Le livre est basé sur l'histoire d'une petite fille malade cachée en elle, Mary Lennox, qui, après avoir perdu ses parents par une épidémie, voyage de l'Inde Misselthwaite Manor, une maison de maître dans le Yorkshire, où son oncle reclus Carven vit. Elle était une enfant égoïste, arrogant et hautain, et elle a toujours obtenu ce qu'il voulait. Elle a jamais eu l'amour de ses parents. Les murs de la maison exsudent tristesse et garder plus d'un mystère. Un jour, bravant les avertissements des adultes, Mary va dans un jardin privé dans le manoir, qui a été fermé pendant dix ans et qui deviendra un refuge magique pour elle-même et pour ses trois nouveaux amis : Colin, son cousin handicapé, Dickon, son innocent et plein de frère de bonté et un rouge-gorge. Les trois enfants et la restauration de robin le site qui à son tour les aideront à construisent une relation particulière qui va changer leur destin à jamais.